Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms