Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP7AQ04656 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms