Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ERCC6Q03468 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms