Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms