Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms