Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms