Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms