Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms