Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMAD3P84022 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms