Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL8P80075 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL8P80075 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL8P80075 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCL8P80075 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL8P80075 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL8P80075 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCL8P80075 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL8P80075 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL8P80075 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL8P80075 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCL8P80075 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL8P80075 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCL8P80075 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL8P80075 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL8P80075 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL8P80075 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL8P80075 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL8P80075 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL8P80075 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL8P80075 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL8P80075 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL8P80075 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL8P80075 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL8P80075 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL8P80075 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL8P80075 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL8P80075 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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