Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP1P63208 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP1P63208 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP1P63208 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP1P63208 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP1P63208 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms