Protein–RNA interactions for Protein: P62502

LCN6, Epididymal-specific lipocalin-6, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN6P62502 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCN6P62502 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCN6P62502 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCN6P62502 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCN6P62502 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCN6P62502 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LCN6P62502 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCN6P62502 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCN6P62502 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCN6P62502 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCN6P62502 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCN6P62502 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCN6P62502 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCN6P62502 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCN6P62502 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCN6P62502 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCN6P62502 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCN6P62502 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCN6P62502 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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LCN6P62502 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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LCN6P62502 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN6P62502 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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LCN6P62502 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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LCN6P62502 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN6P62502 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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