Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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TMEM258P61165 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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TMEM258P61165 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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TMEM258P61165 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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TMEM258P61165 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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TMEM258P61165 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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TMEM258P61165 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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TMEM258P61165 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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TMEM258P61165 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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TMEM258P61165 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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TMEM258P61165 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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TMEM258P61165 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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TMEM258P61165 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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