Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms