Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms