Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52P55327 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPD52P55327 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPD52P55327 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPD52P55327 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPD52P55327 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPD52P55327 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52P55327 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms