Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRISP1P54107 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms