Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms