Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE6CP51160 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms