Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms