Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561P49447 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561P49447 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561P49447 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561P49447 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561P49447 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561P49447 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561P49447 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561P49447 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561P49447 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561P49447 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561P49447 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561P49447 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561P49447 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561P49447 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561P49447 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561P49447 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYB561P49447 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYB561P49447 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYB561P49447 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYB561P49447 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYB561P49447 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYB561P49447 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYB561P49447 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYB561P49447 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYB561P49447 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYB561P49447 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561P49447 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561P49447 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms