Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms