Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NESP48681 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NESP48681 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NESP48681 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NESP48681 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NESP48681 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NESP48681 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NESP48681 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NESP48681 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NESP48681 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NESP48681 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NESP48681 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NESP48681 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NESP48681 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NESP48681 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NESP48681 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NESP48681 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NESP48681 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NESP48681 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NESP48681 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NESP48681 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NESP48681 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NESP48681 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NESP48681 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NESP48681 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NESP48681 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NESP48681 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NESP48681 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NESP48681 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NESP48681 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
NESP48681 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NESP48681 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NESP48681 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NESP48681 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NESP48681 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NESP48681 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NESP48681 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NESP48681 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NESP48681 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NESP48681 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NESP48681 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NESP48681 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NESP48681 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NESP48681 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NESP48681 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NESP48681 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NESP48681 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NESP48681 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NESP48681 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NESP48681 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NESP48681 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NESP48681 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NESP48681 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NESP48681 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NESP48681 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NESP48681 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NESP48681 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NESP48681 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NESP48681 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NESP48681 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NESP48681 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NESP48681 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NESP48681 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NESP48681 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NESP48681 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NESP48681 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NESP48681 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NESP48681 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NESP48681 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NESP48681 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NESP48681 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NESP48681 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NESP48681 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NESP48681 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NESP48681 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NESP48681 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NESP48681 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NESP48681 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NESP48681 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NESP48681 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NESP48681 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NESP48681 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NESP48681 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NESP48681 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NESP48681 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NESP48681 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms