Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRXP46100 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRXP46100 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRXP46100 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATRXP46100 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATRXP46100 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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