Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAGEA3P43357 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms