Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms