Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms