Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBRP36941 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBRP36941 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBRP36941 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms