Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms