Protein–RNA interactions for Protein: P34903

GABRA3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA3P34903 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms