Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 LINC00635-207ENST00000488852 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC090095.1-201ENST00000519275 871 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AL121790.2-201ENST00000553425 379 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC079779.3-201ENST00000588842 1200 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 TRDMT1-210ENST00000488990 1301 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 MFSD8-243ENST00000641695 1455 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC091820.1-201ENST00000523497 648 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CDYLP1-201ENST00000419017 1458 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 NTF3-201ENST00000331010 1028 ntAPPRIS P3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 TMEM59-203ENST00000371341 1116 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 LINC00358-201ENST00000432697 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC011773.4-202ENST00000566000 1264 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 LINC02211-202ENST00000641091 839 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
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