Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms