Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMA5P28066 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms