Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTX3P26022 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms