Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms