Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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