Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms