Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms