Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATF1P18846 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATF1P18846 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATF1P18846 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATF1P18846 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATF1P18846 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATF1P18846 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATF1P18846 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ATF1P18846 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATF1P18846 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATF1P18846 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATF1P18846 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATF1P18846 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATF1P18846 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATF1P18846 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ATF1P18846 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATF1P18846 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATF1P18846 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATF1P18846 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATF1P18846 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ATF1P18846 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATF1P18846 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATF1P18846 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATF1P18846 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATF1P18846 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATF1P18846 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATF1P18846 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATF1P18846 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATF1P18846 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms