Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms