Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PRG2P13727 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG2P13727 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms