Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms