Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT3P12035 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT3P12035 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT3P12035 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT3P12035 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT3P12035 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT3P12035 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT3P12035 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT3P12035 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT3P12035 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT3P12035 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT3P12035 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT3P12035 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT3P12035 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT3P12035 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT3P12035 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT3P12035 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT3P12035 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT3P12035 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT3P12035 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT3P12035 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT3P12035 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT3P12035 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT3P12035 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT3P12035 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT3P12035 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT3P12035 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT3P12035 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT3P12035 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT3P12035 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT3P12035 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT3P12035 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT3P12035 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT3P12035 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT3P12035 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT3P12035 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT3P12035 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT3P12035 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT3P12035 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT3P12035 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT3P12035 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT3P12035 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT3P12035 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT3P12035 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT3P12035 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT3P12035 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT3P12035 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT3P12035 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT3P12035 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT3P12035 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT3P12035 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT3P12035 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT3P12035 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms