Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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UBL4AP11441 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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