Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI2P10070 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI2P10070 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI2P10070 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI2P10070 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI2P10070 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI2P10070 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI2P10070 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI2P10070 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI2P10070 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI2P10070 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI2P10070 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI2P10070 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI2P10070 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI2P10070 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI2P10070 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI2P10070 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI2P10070 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI2P10070 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI2P10070 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI2P10070 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI2P10070 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI2P10070 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI2P10070 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI2P10070 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI2P10070 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI2P10070 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI2P10070 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI2P10070 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI2P10070 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI2P10070 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI2P10070 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI2P10070 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI2P10070 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI2P10070 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI2P10070 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI2P10070 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI2P10070 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI2P10070 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI2P10070 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI2P10070 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI2P10070 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI2P10070 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI2P10070 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI2P10070 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI2P10070 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI2P10070 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI2P10070 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI2P10070 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI2P10070 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI2P10070 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI2P10070 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI2P10070 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI2P10070 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI2P10070 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI2P10070 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI2P10070 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI2P10070 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI2P10070 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI2P10070 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI2P10070 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI2P10070 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI2P10070 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI2P10070 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI2P10070 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI2P10070 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI2P10070 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI2P10070 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI2P10070 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI2P10070 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI2P10070 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI2P10070 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI2P10070 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI2P10070 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI2P10070 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms