Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C8orf88P0DMB2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms