Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD2P0DJD1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms