Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLK3P07288 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLK3P07288 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms