Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSTAP01040 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSTAP01040 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTAP01040 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTAP01040 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTAP01040 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTAP01040 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTAP01040 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTAP01040 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTAP01040 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTAP01040 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTAP01040 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTAP01040 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTAP01040 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTAP01040 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTAP01040 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSTAP01040 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms