Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZBED1O96006 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED1O96006 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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